近日,动科院周荣艳教授领衔的畜禽种业创新团队在《Poultry Science》期刊在线发表了题为“Population Genomics Reveals that a Missense Mutation in EDNRB2 Contributes to White Plumage Color in Pigeons”的研究成果。该研究首次鉴定到与肉鸽白羽形成的因果突变EDNRB2基因的E256K,为鸽羽色性状遗传机理解析及高效改良提供了支撑。
《本草纲目》中记载“鸽羽色众多,唯白色入药”,在肉用鸽生产中,白羽鸽因其外貌和浅色的皮肤受人们的欢迎。利用全基因组分析鉴定出与白羽虹膜颜色的因果突变,且推测白羽与虹膜颜色呈连锁状态并发现EDNRB2基因为候选基因,然而,由于鸽基因组注释信息不完整,限制了对白羽形成的因果变异的鉴定。
为了解决上述问题,本研究利用基因组注释信息对新版本鸽基因组进行重新注释,基于全基因组数据和统计量(滑窗Fst、单位点pFst、/Fst、Tajima D、iHS和XP-EHH)筛选白羽鸽受选择区域,对受选择区域的基因进行注释,结合Uniprot数据库明确了白羽表型的形成的因果变异为EDNRB2基因第四外显子错义突变位点E256K。该研究结果为鸽羽色性状遗传机理解析奠定了重要基础,也为该性状选育提供了重要支撑。
群体基因组学策略鉴定主效基因及功能突变模式图
本研究是我校周荣艳教授团队在利用群体基因组学策略解析鸽羽色性状遗传机理研究方面取得的重要进展。我校硕士生毛楠楠为论文第一作者,周荣艳教授为通讯作者。
原文链接:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0032579123007447